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基于分子对接及分子动力学模拟的中药来源 II 型2020-07-10

                                     基于分子对接及分子动力学模拟的中药来源 II 型 5α-还原酶抑制剂筛选

摘 要: 目的 基于分子对接及分子动力学模拟方法从中药活性成分中寻找潜在的 II 型 5α-还原酶( 5αR2) 抑制剂。
方法 采用分子对接方法对中药来源的 26 种单体成分进行对接,根据对接结果,对与蛋白结合较强的化合物进行分子
动力学模拟,采用 MM/PBSA 方法计算体系的结合自由能;通过体外微量酶反应体系进行生物活性验证。 结果 26
种单体成分与 5αR2具有不同程度的结合能,其中女贞苷、红花黄色素和扁柏双黄酮的结合能较低,结合能力强;分
子动力学模拟结果与对接结果相一致(结合能力:女贞苷-蛋白>红花黄色素-蛋白>扁柏双黄酮-蛋白);活性实验结
果显示 3 种成分对 5αR2 具有一定的抑制作用,女贞苷半数抑制浓度( IC50)值为( 42.12± 3.83) μmol/L,红
黄黄色素 IC50 值为( 69.06± 6.35) μmol/L,扁柏双黄酮 IC50 值为( 191.28± 5.90) μmol/L。 结论 筛选的
26 个单体成分中,女贞苷、红花黄色素和扁柏双黄酮具有预防和治疗雄激素依赖型疾病新药研发的潜力,为探索新
型 5αR2 抑制剂提供参考。
关键词: II 型 5α-还原酶;分子对接;分子动力学模拟;中药活性成分;女贞苷;红花黄色素;扁柏双黄酮
中图分类号: R285.5 文献标志码: A 文章编号: 0253 - 2670(2020)10 - 2819 - 09
DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.10.024

1 材料
1.1 仪器
LC-20A 高效液相色谱仪(日本岛津公司);色
谱柱[COSMOSIL 5C18-MS-II 柱( 250 mm× 2.6 mm,
5 μm)]; TGL-16 型高速低温离心机(湖南湘仪实
验室仪器开发有限公司); SB-1200 型恒温水浴锅
(上海爱朗仪仪器有限公司)。
1.2 药品与试剂
红花黄色素(质量分数 98%, 批号 AF8030707)
成都埃法生物科技有限公司;扁柏双黄酮(质量分

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